Gblocks 0.91b Results

Processed file: 16S.fasta.align
Number of sequences: 3
Alignment assumed to be: DNA
New number of positions: 1486 (selected positions are underlined in blue)

                         10        20        30        40        50        60
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
LBX12            ggctcaggacgaacgctggcggcgtgcctaatacatgcaagtcgagcggacagatgggag
LBX21B           ggctcaggacgaacgctggcggcgtgcctaatacatgcaagtcgagcggacagatgggag
X60              ggctcaggacgaacgctggcggcgtgcctaatacatgcaagtcgagcggacagatgggag
                 ############################################################


                         70        80        90       100       110       120
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
LBX12            cttgctccctgatgttagcggcggacgggtgagtaacacgtgggtaacctgcctgtaaga
LBX21B           cttgctccctgatgttagcggcggacgggtgagtaacacgtgggtaacctgcctgtaaga
X60              cttgctccctgatgttagcggcggacgggtgagtaacacgtgggtaacctgcctgtaaga
                 ############################################################


                        130       140       150       160       170       180
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
LBX12            ctgggataactccgggaaaccggggctaataccggatgcttgtttgaaccgcatggttca
LBX21B           ctgggataactccgggaaaccggggctaataccggatgcttgtttgaaccgcatggttca
X60              ctgggataactccgggaaaccggggctaataccggatgcttgtttgaaccgcatggttca
                 ############################################################


                        190       200       210       220       230       240
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
LBX12            aacataaaaggtggcttcggctaccacttacagatggacccgcggcgcattagctagttg
LBX21B           aacataaaaggtggcttcggctaccacttacagatggacccgcggcgcattagctagttg
X60              aacataaaaggtggcttcggctaccacttacagatggacccgcggcgcattagctagttg
                 ############################################################


                        250       260       270       280       290       300
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
LBX12            gtgaggtaacggctcaccaaggcaacgatgcgtagccgacctgagagggtgatcggccac
LBX21B           gtgaggtaacggctcaccaaggcaacgatgcgtagccgacctgagagggtgatcggccac
X60              gtgaggtaacggctcaccaaggcaacgatgcgtagccgacctgagagggtgatcggccac
                 ############################################################


                        310       320       330       340       350       360
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
LBX12            actgggactgagacacggcccagactcctacgggaggcagcagtagggaatcttccgcaa
LBX21B           actgggactgagacacggcccagactcctacgggaggcagcagtagggaatcttccgcaa
X60              actgggactgagacacggcccagactcctacgggaggcagcagtagggaatcttccgcaa
                 ############################################################


                        370       380       390       400       410       420
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
LBX12            tggacgaaagtctgacggagcaacgccgcgtgagtgatgaaggttttcggatcgtaaagc
LBX21B           tggacgaaagtctgacggagcaacgccgcgtgagtgatgaaggttttcggatcgtaaagc
X60              tggacgaaagtctgacggagcaacgccgcgtgagtgatgaaggttttcggatcgtaaagc
                 ############################################################


                        430       440       450       460       470       480
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
LBX12            tctgttgttagggaagaacaagtaccgttcgaatagggcggtaccttgacggtacctaac
LBX21B           tctgttgttagggaagaacaagtaccgttcgaatagggcggtaccttgacggtacctaac
X60              tctgttgttagggaagaacaagtaccgttcgaatagggcggtaccttgacggtacctaac
                 ############################################################


                        490       500       510       520       530       540
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
LBX12            cagaaagccacggctaactacgtgccagcagccgcggtaatacgtaggtggcaagcgttg
LBX21B           cagaaagccacggctaactacgtgccagcagccgcggtaatacgtaggtggcaagcgttg
X60              cagaaagccacggctaactacgtgccagcagccgcggtaatacgtaggtggcaagcgttg
                 ############################################################


                        550       560       570       580       590       600
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
LBX12            tccggaattattgggcgtaaagggctcgcaggcggtttcttaagtctgatgtgaaagccc
LBX21B           tccggaattattgggcgtaaagggctcgcaggcggtttcttaagtctgatgtgaaagccc
X60              tccggaattattgggcgtaaagggctcgcaggcggtttcttaagtctgatgtgaaagccc
                 ############################################################


                        610       620       630       640       650       660
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
LBX12            ccggctcaaccggggagggtcattggaaactggggaacttgagtgcagaagaggagagtg
LBX21B           ccggctcaaccggggagggtcattggaaactggggaacttgagtgcagaagaggagagtg
X60              ccggctcaaccggggagggtcattggaaactggggaacttgagtgcagaagaggagagtg
                 ############################################################


                        670       680       690       700       710       720
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
LBX12            gaattccacgtgtagcggtgaaatgcgtagagatgtggaggaacaccagtggcgaaggcg
LBX21B           gaattccacgtgtagcggtgaaatgcgtagagatgtggaggaacaccagtggcgaaggcg
X60              gaattccacgtgtagcggtgaaatgcgtagagatgtggaggaacaccagtggcgaaggcg
                 ############################################################


                        730       740       750       760       770       780
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
LBX12            actctctggtctgtaactgacgctgaggagcgaaagcgtggggagcgaacaggattagat
LBX21B           actctctggtctgtaactgacgctgaggagcgaaagcgtggggagcgaacaggattagat
X60              actctctggtctgtaactgacgctgaggagcgaaagcgtggggagcgaacaggattagat
                 ############################################################


                        790       800       810       820       830       840
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
LBX12            accctggtagtccacgccgtaaacgatgagtgctaagtgttagggggtttccgcccctta
LBX21B           accctggtagtccacgccgtaaacgatgagtgctaagtgttagggggtttccgcccctta
X60              accctggtagtccacgccgtaaacgatgagtgctaagtgttagggggtttccgcccctta
                 ############################################################


                        850       860       870       880       890       900
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
LBX12            gtgctgcagctaacgcattaagcactccgcctggggagtacggtcgcaagactgaaactc
LBX21B           gtgctgcagctaacgcattaagcactccgcctggggagtacggtcgcaagactgaaactc
X60              gtgctgcagctaacgcattaagcactccgcctggggagtacggtcgcaagactgaaactc
                 ############################################################


                        910       920       930       940       950       960
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
LBX12            aaaggaattgacgggggcccgcacaagcggtggagcatgtggtttaattcgaagcaacgc
LBX21B           aaaggaattgacgggggcccgcacaagcggtggagcatgtggtttaattcgaagcaacgc
X60              aaaggaattgacgggggcccgcacaagcggtggagcatgtggtttaattcgaagcaacgc
                 ############################################################


                        970       980       990      1000      1010      1020
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
LBX12            gaagaaccttaccaggtcttgacatcctctgacaatcctagagataggacgtccccttcg
LBX21B           gaagaaccttaccaggtcttgacatcctctgacaatcctagagataggacgtccccttcg
X60              gaagaaccttaccaggtcttgacatcctctgacaatcctagagataggacgtccccttcg
                 ############################################################


                       1030      1040      1050      1060      1070      1080
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
LBX12            ggggcagagtgacaggtggtgcatggttgtcgtcagctcgtgtcgtgagatgttgggtta
LBX21B           ggggcagagtgacaggtggtgcatggttgtcgtcagctcgtgtcgtgagatgttgggtta
X60              ggggcagagtgacaggtggtgcatggttgtcgtcagctcgtgtcgtgagatgttgggtta
                 ############################################################


                       1090      1100      1110      1120      1130      1140
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
LBX12            agtcccgcaacgagcgcaacccttgatcttagttgccagcattcagttgggcactctaag
LBX21B           agtcccgcaacgagcgcaacccttgatcttagttgccagcattcagttgggcactctaag
X60              agtcccgcaacgagcgcaacccttgatcttagttgccagcattcagttgggcactctaag
                 ############################################################


                       1150      1160      1170      1180      1190      1200
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
LBX12            gtgactgccggtgacaaaccggaggaaggtggggatgacgtcaaatcatcatgcccctta
LBX21B           gtgactgccggtgacaaaccggaggaaggtggggatgacgtcaaatcatcatgcccctta
X60              gtgactgccggtgacaaaccggaggaaggtggggatgacgtcaaatcatcatgcccctta
                 ############################################################


                       1210      1220      1230      1240      1250      1260
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
LBX12            tgacctgggctacacacgtgctacaatggacagaacaaagggcagcgaaaccgcgaggtt
LBX21B           tgacctgggctacacacgtgctacaatggacagaacaaagggcagcgaaaccgcgaggtt
X60              tgacctgggctacacacgtgctacaatggacagaacaaagggcagcgaaaccgcgaggtt
                 ############################################################


                       1270      1280      1290      1300      1310      1320
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
LBX12            aagccaatcccacaaatctgttctcagttcggatcgcagtctgcaactcgactgcgtgaa
LBX21B           aagccaatcccacaaatctgttctcagttcggatcgcagtctgcaactcgactgcgtgaa
X60              aagccaatcccacaaatctgttctcagttcggatcgcagtctgcaactcgactgcgtgaa
                 ############################################################


                       1330      1340      1350      1360      1370      1380
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
LBX12            gctggaatcgctagtaatcgcggatcagcatgccgcggtgaatacgttcccgggccttgt
LBX21B           gctggaatcgctagtaatcgcggatcagcatgccgcggtgaatacgttcccgggccttgt
X60              gctggaatcgctagtaatcgcggatcagcatgccgcggtgaatacgttcccgggccttgt
                 ############################################################


                       1390      1400      1410      1420      1430      1440
                 =========+=========+=========+=========+=========+=========+
LBX12            acacaccgcccgtcacaccacgagagtttgtaacacccgaagtcggtgaggtaacctttt
LBX21B           acacaccgcccgtcacaccacgagagtttgtaacacccgaagtcggtgaggtaacctttt
X60              acacaccgcccgtcacaccacgagagtttgtaacacccgaagtcggtgaggtaacctttt
                 ############################################################


                       1450      1460      1470      1480
                 =========+=========+=========+=========+======
LBX12            aggagccagccgccgaaggtgggacagatgattggggtgaagtcgt
LBX21B           aggagccagccgccgaaggtgggacagatgattggggtgaagtcgt
X60              aggagccagccgccgaaggtgggacagatgattggggtgaagtcgt
                 ##############################################






Parameters used Minimum Number Of Sequences For A Conserved Position: 2 Minimum Number Of Sequences For A Flanking Position: 2 Maximum Number Of Contiguous Nonconserved Positions: 8 Minimum Length Of A Block: 10 Allowed Gap Positions: With Half
Flank positions of the 1 selected block(s)
Flanks: [1  1486]  

New number of positions in 16S.fasta.align-gb:  1486  (100% of the original 1486 positions)