Processed file: 16S.fasta.align
Number of sequences: 3
Alignment assumed to be: DNA
New number of positions: 1486 (selected positions are underlined in blue)
10 20 30 40 50 60
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LBX12 ggctcaggacgaacgctggcggcgtgcctaatacatgcaagtcgagcggacagatgggag
LBX21B ggctcaggacgaacgctggcggcgtgcctaatacatgcaagtcgagcggacagatgggag
X60 ggctcaggacgaacgctggcggcgtgcctaatacatgcaagtcgagcggacagatgggag
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70 80 90 100 110 120
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LBX12 cttgctccctgatgttagcggcggacgggtgagtaacacgtgggtaacctgcctgtaaga
LBX21B cttgctccctgatgttagcggcggacgggtgagtaacacgtgggtaacctgcctgtaaga
X60 cttgctccctgatgttagcggcggacgggtgagtaacacgtgggtaacctgcctgtaaga
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130 140 150 160 170 180
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LBX12 ctgggataactccgggaaaccggggctaataccggatgcttgtttgaaccgcatggttca
LBX21B ctgggataactccgggaaaccggggctaataccggatgcttgtttgaaccgcatggttca
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190 200 210 220 230 240
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LBX12 aacataaaaggtggcttcggctaccacttacagatggacccgcggcgcattagctagttg
LBX21B aacataaaaggtggcttcggctaccacttacagatggacccgcggcgcattagctagttg
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250 260 270 280 290 300
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310 320 330 340 350 360
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370 380 390 400 410 420
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430 440 450 460 470 480
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490 500 510 520 530 540
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610 620 630 640 650 660
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LBX12 ccggctcaaccggggagggtcattggaaactggggaacttgagtgcagaagaggagagtg
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670 680 690 700 710 720
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730 740 750 760 770 780
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LBX12 actctctggtctgtaactgacgctgaggagcgaaagcgtggggagcgaacaggattagat
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790 800 810 820 830 840
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850 860 870 880 890 900
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LBX12 gtgctgcagctaacgcattaagcactccgcctggggagtacggtcgcaagactgaaactc
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910 920 930 940 950 960
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LBX12 aaaggaattgacgggggcccgcacaagcggtggagcatgtggtttaattcgaagcaacgc
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1030 1040 1050 1060 1070 1080
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LBX12 ggggcagagtgacaggtggtgcatggttgtcgtcagctcgtgtcgtgagatgttgggtta
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1090 1100 1110 1120 1130 1140
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LBX12 agtcccgcaacgagcgcaacccttgatcttagttgccagcattcagttgggcactctaag
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1150 1160 1170 1180 1190 1200
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1210 1220 1230 1240 1250 1260
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LBX12 tgacctgggctacacacgtgctacaatggacagaacaaagggcagcgaaaccgcgaggtt
LBX21B tgacctgggctacacacgtgctacaatggacagaacaaagggcagcgaaaccgcgaggtt
X60 tgacctgggctacacacgtgctacaatggacagaacaaagggcagcgaaaccgcgaggtt
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1270 1280 1290 1300 1310 1320
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LBX12 gctggaatcgctagtaatcgcggatcagcatgccgcggtgaatacgttcccgggccttgt
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1390 1400 1410 1420 1430 1440
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LBX12 acacaccgcccgtcacaccacgagagtttgtaacacccgaagtcggtgaggtaacctttt
LBX21B acacaccgcccgtcacaccacgagagtttgtaacacccgaagtcggtgaggtaacctttt
X60 acacaccgcccgtcacaccacgagagtttgtaacacccgaagtcggtgaggtaacctttt
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1450 1460 1470 1480
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LBX12 aggagccagccgccgaaggtgggacagatgattggggtgaagtcgt
LBX21B aggagccagccgccgaaggtgggacagatgattggggtgaagtcgt
X60 aggagccagccgccgaaggtgggacagatgattggggtgaagtcgt
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Parameters used Minimum Number Of Sequences For A Conserved Position: 2 Minimum Number Of Sequences For A Flanking Position: 2 Maximum Number Of Contiguous Nonconserved Positions: 8 Minimum Length Of A Block: 10 Allowed Gap Positions: With Half
Flank positions of the 1 selected block(s) Flanks: [1 1486] New number of positions in 16S.fasta.align-gb: 1486 (100% of the original 1486 positions)