GFOLD的安装与使用

一. GFOLD简介

GFOLD是由同济大学生物信息系张勇教授课题组研发的软件。gfold主要用于RNA-seq数据的差异表达基因分析,特别适合于实验没有重复的情况。

二. GFOLD的安装

GFOLD的安装需要安装gsl-1.15

安装gsl-1.15
$ wget ftp://ftp.gnu.org/gnu/gsl/gsl-1.15.tar.gz
$ tar zxf gsl-1.15.tar.gz
$ cd gsl-1.15
$ ./configure
$ make -j 8
$ sudo make install

安装gfold
$ wget https://bitbucket.org/feeldead/gfold/get/e78560195469.zip
$ unzip e78560195469.zip
$ cd feeldead-gfold-e78560195469
$ make
$ cd ../ ; mv feeldead-gfold-e78560195469 gfold

三. GFOLD的使用

使用gfold,发现结果没有cufflinks得出的结果好。该软件相对简单快速。不推荐使用。

GFOLD的安装与使用》上有3条评论

  1. 师兄,我想问一下,你的服务器是自己租的还是实验室的呢》?域名呢?我想自己建一个wordpress博客,想请教一下你,不知道怎么弄。谢谢

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