UniProtKB

1. UniProtKB是什么?
UnProtKB,即UniProt Knowledgebase,主要包括两个部分:UniProtKB/Swiss-Prot和UniProtKB/TrEMBL。其中UniProtKB/Swiss-Prot是手工注释和修正的蛋白质数据库,来源于实验结果,计算和科学结论。后来由于精确的Swiss-Prot数据库无法很快得以扩大从而包含所有的蛋白质序列,于是加入了UniProtKB/TrEMBL这一部分,该数据库蛋白质主要经过计算来进行自动注释,分类。
2. UniProtKB下载
UniProt数据库每4周更新一次,下载地址如下:

ftp://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/current_release/knowledgebase/complete/uniprot_sprot.fasta.gz
ftp://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/current_release/knowledgebase/complete/uniprot_trembl.fasta.gz
uniprot_sprot.fasta.gz 56M
uniprot_trembl.fasta.gz 5.3G

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