1. JBrowse 简介
2. JBrowse 下载和安装
下载 JBrowse 安装包,并安装:
$ wget http://jbrowse.org/releases/JBrowse-1.11.5.zip $ wget http://jbrowse.org/releases/JBrowse-1.11.5-dev.zip $ unzip JBrowse-1.11.5.zip -d /opt/biosoft $ unzip JBrowse-1.11.5-dev.zip -d /opt/biosoft $ cd /opt/biosoft/JBrowse-1.11.5 $ sudo ./setup.sh $ echo 'PATH=$PATH:/opt/biosoft/JBrowse-1.11.5' >> ~/.bashrc
配置 apache:
# echo 'Alias /JBrowse "/opt/biosoft/JBrowse-1.11.5/" <Directory "/opt/biosoft/JBrowse-1.11.5/"> Options MultiViews ExecCGI Indexes FollowSymlinks AllowOverride None Order allow,deny Allow from all </Directory>' > /etc/httpd/conf.d/JBrowse.conf # /etc/init.d/httpd restart
打开软件自带的示例 Volvox JBrowse。