生物信息学平台Galaxy的安装与使用

1. Galaxy初步安装

推荐使用root用户安装,首先下载软件
$ git clone https://github.com/galaxyproject/galaxy.git
$ cd galaxy
联网下载并安装一些依赖的软件和模块
$ sh run.sh
    安装完毕后,Galaxy开始运行。此时,Galaxy只能在本地机器上访问

若需要联网访问,则生成Galaxy的配置文件,并设置相关参数。
$ cp config/galaxy.yml.sample config/galaxy.yml
运行在其它机器上使用指定的IP地址通过8080端口访问Galaxy
$ perl -p -i -e 's/^(\s+)http:.*/${1}http: 122.205.95.116:8080/' config/galaxy.yml

此外,还需额外开启防火墙8080端口后,再次启动Galaxy
$ sh run.sh

发表评论

电子邮件地址不会被公开。 必填项已用*标注