一. Velvet简介

Velvet 是 EBI 的 Daniel Zerbino and Ewan Birney 开发的利用short reads组装基因组的软件。
Velvet作为一种de novo基因组组装软件，可利用的reads包括 Illumina reads 和 454 reads。
引用文献(2008)：Velvet: algorithms for de novo short read assembly using de Bruijn graphs.

二. Velvet下载与安装

make ‘CATEGORIES=57’ ‘MAXKMERLENGTH=75’ ‘BIGASSEMBLY=1’ ‘LONGSEQUENCES=1’ ‘OPENMP=1’ ‘BUNDLEDZLIB=1’