由于之前的1年将文章全都写入到其它地方。而现在我的博客完全转移到了阿里云平台,因此更加稳定了。现在将博客内容转移到过来。
分类目录归档:日常生活
呼吸益肾回春术
呼吸益肾法是中国古老的一种回春术,先将体内污浊空气全部排出,然后再把新鲜空气吸进去,这种呼吸方法称之为“吐故纳新”,也是呼吸益肾法的基础。呼吸法能使人身健康,预防疾病,进而能防止衰老,达到益精回春,旺盛性功能的效果。
1. 腹式呼吸法
两手放在肚脐下,就可以轻易地察觉出空气腹内的情况。姿势可立可坐,慢慢地吸氧,然后在刹那间将它大口吐出。习惯腹式呼吸法之后,再求精神贯一。只要有空,随时可进行2、3分钟。此法使腹部肌肉充分的收缩再放松,可加速血液循环,消除腹腔,肠系膜的瘀血。如此继续两周,身体就会自然感到清爽,食欲大增,肌肤红润。
2. 吸缩呼胀法
此种呼吸法是上述腹式呼吸法的逆呼吸法,中国古代仙人做为长寿不老回春术的秘修之法。
首先坐在椅子上,或取立姿,开始时将肺中污浊空气排出,然后将肌肉放松使全身力量消除,然后再努力吸气,将腹部用力往里收缩至最大程度为止。接着把肩部放松,一面使腹部胀起来,慢慢将空气吐出,反复练习2至3次以后,就能简单地使用此法了。
此外,要注意吸气时将舌尖巾于上齿后面,完全用鼻子来吸气;吐气时舌头要附于下颔由口中吐气。练习此法,要精神贯注,使自己觉得气流到体内的每个角落。
3. 提肛益肾法
这种提肛运动益肾很简单。首先坐在椅子上,使精神集中,轻闭双目,然后慢慢地在肛门上用力,再使用一口气将它缩紧,有如排尿时中途停止的要领一样。接着立刻将力量放松,使肛门松弛,把肛门再次地收缩、放松,如此反复地作3分钟,就会熟练。
在肛门收缩时,阴茎就会提高,象拉弓似的感觉,每日反复练习,括约肌就会变强,久之勃起可随心所欲。
提肛运动不仅能张精,且有长寿不老、永葆青春的效果。
4. 回春式呼吸法
把“腹式呼吸法”、“吸缩呼胀法”与“提肛运动”结合起来的益精法,称为回春式呼吸法,反复练习,可有很大的益肾强精效果。
此法是吸气时使腹部凹下去,同时配合一定的时间,把肛门的括约肌也紧紧地收缩;反之在吐气时,使肛门括约肌松弛。练习此法还要注意,吸气时要慢慢地、深深地使气吸到肛门的部位,深深的吸气,然后再慢慢地放松
2012-2013学年度 学年鉴定
博士3年级完毕了,仍要继续到4年级。
我在硕士研究生阶段主要从事了茯苓连作障碍的研究,但最终没有实际的成果。我反省了下,认为是以下3个原因造成的:1. 性格因素。当时还比较年少,责任心不够,同时对硕士研究生的内涵理解肤浅。这些造成了对做实验的态度不积极,在科学研究的时间上投入太少;2. 课题特性。茯苓的连作障碍,这个课题偏向基础性研究,同时,有关于连作障碍的机理还未有在其它物种中有报道,一般只是一些猜测和讨论。相较于我们实验室的科研水平,这个课题算是比较难的;3. 耗材与仪器。主要实验所需要的耗材一般要等2~3个月,而仪器是使用外校实验室的仪器。这样在时间和仪器使用和人员沟通上比较费事。后来,虽然在这个课题上做出了一点成果,但是也未能很好地总结出一点成果,用于发表文章。最后,转博后,将工作重心放到了生物信息学的研究上。
从博士1年级开始,逐步摸索生物信息学,到现在算是两年半了。到现在,对生物信息学的掌握程度自认为可以算是专家了。生物信息学是现在的潮流和前沿,特别是基于第二代测序技术发展而来的一系列新的事物。因此,生物信息学成了一个很新很难的学科,同时,各个实验室对生物信息学的需求与日俱增。
在掌握这些最新的生物信息学技能与知识的道路上,我经历了许多的孤独与坎坷,通过不断看文献,找新方法和新软件,阅读文档,找它人心得等方法,不断去掌握生物信息学的技能。到现在,对生物信息学的很多方法和软件有了宏观和详细的认知,对生物信息学的技能掌握得越来越快。同时,也和很多专业人士的交流也越来越多。
在过去的一年中,是我学习和掌握生物信息学知识最多的一年了,收获良多。学习并熟练掌握的知识主要有:基因组De novo组装、基因预测、RNA-Seq分析、基因组浏览器Gbrowse的使用、基因功能注释、同源基因分析等。上面每一项的生物信息分析都包含很多内容,比较复杂。由于对NGS的数据分析能力,我算是走在了很多人的前头。于是,在刚过去的暑期中,我成功举办了一个NGS数据分析的交流会,将我的经验分享给了很多华农和外地的同学或老师们。
在过去的一年中,我的思想成熟得很快,学习很认真,工作也比较努力。这一年,我的学识上有了飞速的增长。特别是在刚过去的暑期,我参加了上海复旦大学举办的为期10天的进化分析专题培训班和哈尔滨医科大学举办的为期5天的偏向医学的生物信息学培训班。现在,我对生物信息学的宏观把握上算是胸有成竹,对我所在领域的生物信息学技能熟练掌握,对明确知道我今后的生物信息学发展道路。
在过去的一年中,虽然积累了知识和技能,但是未有成果和文章。接下来的一年中,我会将重心放到文章的点子上,争取能早日毕业!
我的第一届生物信息学培训班总结
1 培训的准备
在今年4月份的时候就萌生了一个想法,想将自己学到的一些生物信息学知识分享给它人,同时也赚点生活费。后来偶然在一个生物信息的群里面,有人说很想在暑期去上生物信息学班,学习到实用的知识;同时又抱怨华大等举办的生物信息学培训班不仅学费贵,同时也学不到自己动手的东西。于是我就写到考虑在暑期办一个培训班。于是当时一冲动,就在华中农业大学的南湖论坛上发了一个帖子,说想要开一个生物信息学的班。后来很多人回复并感兴趣,于是这成了我举办生物信息学培训班的最大动力。后来在一些回复的要求下建立了一个qq群,于是将培训班的事业拉倒正轨上。
开班培训班,则必须要有培训资料,于是就开始整理培训资料。其实这些培训资料很多都是取自我零零散散写到我的blog上的内容。在今年暑假7.14-7.24日,我参加了复旦大学举办的一个进化分析的培训班。那个时候白天上课,晚上就在宾馆写培训资料,同时准备上课的数据。培训资料和数据的准备绝大部分是在那个时候完成的,当然,由于比较匆忙,在最后一章的内容就写得粗糙了,同时培训资料中还有很多的错别字等。
通过qq群的通知,培训时间确定在7.27日下午3点进行一个试讲,讲述培训的大纲;而从7.28日开始正式的讲课。
2 培训内容
这次的生物信息培训主要是NGS数据的分析,是现在比较成熟又热门的知识。讲解了基因组的组装、基因预测、SNP分析、转录组分析、基因功能注释等,还包含了网站搭建,mysql使用和perl编程等。全程课程主要偏重实践运用于上机操作,而原理方面则不会深究。
本次培训的大纲如下:
1.CentOS 6.4 x86_64的安装 2.Linux系统入门 3.Next Generation Sequencing Techonology 4.基因组组装 5.Genom Repeat Sequence Prediction 6.短序列比对 7.Perl入门 8.Variants calling 9.转录组分析 10.基因预测 11.基因组浏览器Gbrowse 12.基因功能注释与富集分析
培训讲义资料有151面,内容还是很丰富的。
3 培训情况
在7.27日下午3点开始培训前试讲,当时天气很热,空调刚开,但是大出我的预料,来了很多人,将会议室都挤满了。现场报名,报名费相对便宜,500元。由于场地不够大,于是随机抽取了部分有意向的人报名,最后总共报名人数27人。当然,有一个高级博后从上海专程到这儿来听课的,像这样的需要优先考虑。报名时,当时收钱的感觉还是很爽的,嘿嘿…这算是我人生的第一桶金,但是紧接而来则是要多学员负责,要教给他们有用的知识了。
培训,准确说是集训,从7.28日开始,每天早上9:00-12:00,下午2:00-5:00,晚上7:00-9:00上课。这样总共持续了10天,其中包含放假了一天。刚开始两天,早中晚都讲课,后来晚上就专门用来练习,手把手答疑了。最后一天,人人都很累,同时培训资料最后一章也写得比较简略,数据也准备的不是很充分,于是结束课程也算比较匆忙。想起来,当初我做刚生物信息学,就是从最后一章基因功能注释的内容开始的,对这一章的内容,其实了解得非常深入。
最后,所有的学员在实验室门前合了一张影,作为留恋:
4 我的培训收获
通过这次培训,我认识了一些人,很多人给我留下了深刻的印象。比如:从上海特异过来的高级博后,本身对NGS分析很感兴趣,学得很快;基因楼的爱学习,喜欢辩论的小伙子;在测序公司工作几年后回来继续读书的,问题很多的同学;还有刚发表了Nature techonology马上去瑞士读博士的牛人;在空调口吹风又很活跃的一群人;也有喜欢钻研的女生等。
培训课上也有一些同学退学,也有一些同学加入,也有人苦苦支撑到最后。
作为老师,我也学到了很多上课经验。在培训课上,上课是讲一会儿,上机一会儿,造成了课间休息不规律;上课节奏要慢,吐词要清晰等。当然,对培训课程进度的把握,现在有了经验。原本准备在3~5天内讲完,但是在很快的节奏下也需要了9天的时间。
5 总结
本次培训,通过手把手教导怎么进行NGS分析与上级操作,学员们最后能独自自主进行高质量的:基因组组装,SNP和INDEL检测,基因预测及其可视化,转录组分析,基因功能注释等。
培训资料最后只是发放了纸质版的,电子版的由于版权等问题暂时保留在我手上。以后要是有时间,我考虑要出一本NGS分析的生物信息学书籍。
培训班在8.6日结束,随后8.13-8.25参加了在哈尔滨医科大学举办的生物信息学培训。于是原本预算的第二届生物信息学培训班就没有举办了。这个时候群里面的王志文在群里面打了下广告,貌似在洪山体育馆那儿举办了一期生物信息学培训班。
慢慢筹备我的下一次的培训吧,估计内容会更加丰富…
神秘学:轮回,灵魂,通灵…
1. 灵魂与轮回
今天一QQ好友说信主已有1年多,出于好奇,我于是对其信仰和他讨论了一下。
为什么信主,他说:“耶稣是永生神的儿子,他为了世人的罪被订在十字架上死了;人是有灵魂的,信了耶稣,死后灵魂就可以去天堂和神在一起。”
他说其小时候的经历让他相信了灵魂的存在:“以前小时候我大伯带我去游泳,我想从游泳池边上跳到水中游泳圈里,结果跳歪了,没进游泳圈旁边去了。然后我就看见我在水里挣扎,看见哦,就是灵魂出窍了。”
我想估计是他小时候的事情让他相信了灵魂的存在,现在他在国外接触了一些教义,顺其自然地信主。他推荐我读这本书:Many Lives Many Masters。他说通过这本书能知道灵魂确实是存在的。
《Many Lives Many Masters》这本书的中文名是《前世今生,生命轮回的前世疗法》,作者Brian L. Weiss。可以在百度百科中查看本书的介绍。
本书中描述了人在死后,灵魂进入一道温暖的白光中,可能会与灵性大师交流,然后进行下一轮命运。作者作为心理医生,对一名女性患者使用催眠术进行治疗,揭露了其很多轮前世的记忆片段;而作者重点关注了其死亡时的片段。
2. 通灵
在《Many Lives Many Masters》书最后,作者说其女性患者又通过一名通灵占星师对其前世的预测,和催眠得到的结果一致。
于是我有又想找一些通灵相关的东西,于是找到了介绍嘎玛仁波切传奇事件的博客:湖心亭看雪客新浪博客和有关轮回的《西藏生死书》
wordpress插件
1. Akismet
用途:博客垃圾评论 / trackback 屏蔽解决方案。效果非常好。
需要的Akismet API 密钥:c28ea9690585
2. WP-Chinese-Excerpt
用途:在主页上只显示中文摘要。开启该插件则会有效果。编辑文章的时候最好写个摘要。其原版插件名为:WP-UTF8-Excerpt
mplayer播放参数与设置
一. mplayer双字幕设置
直接将中英字幕文件合并成一个文件即可,即可直接用于双字幕mplayer播放。
$ cat my_film.chs.srt my_film.eng.srt > my_film.srt $ mplayer -ass my_film.mkv -sub my_film.srt 当中文字母加载出现乱码,使用 -ass 参数。
二. mplayer播放调节参数
1. 字幕参数:
x 和 z 调整字幕延迟增加/减少 0.1 秒 r 和 t 上/下调整字幕位置 v 关闭或打开字幕 j 切换字幕,对应的字幕位于视频同一目录下并文件名一致
2. 声音参数:
+ 和 - 调整音频延迟增加/减少 0.1 秒 / 和 * 降低/提高音量 9 和 0 降低/提高音量 m 静音开关 # 循环可用的音轨
3. 播放控制参数:
左方向键 和 右方向键 后退/快进 10 秒钟 上方向键 和 下方向键 快进/后退 1 分钟 pgup 和 pgdown 快进/后退 10 分钟 [ 和 ] 减少/增加当前播放速度 10% { 和 } 减半/加倍当前播放速度 p / SPACE 暂停 (再按取消暂停) q / ESC 停止播放和退出
4. 屏幕参数
f 切换全屏 T 切换置顶 o 循环OSD状态:即显示播放计时 P 在 OSD 上显示进度条、已播放时间以及总长度信息
PubMed与PMC的区别
PubMed Central (PMC 公共医学中心)是一个提供有关生命科学与生物医学的回溯性电子期刊全文数据库,它是在2000年1月由隶属美国国立图书馆(NLM)的国家生物技术信息中心(NCBI)所创建与管理的。PMC采取自愿加入的原则,某期刊一旦加入,必须承诺期刊出版后一定时期内(最好六个月,不超过1年)将其全文提交给PMC,由PMC提供免费全文检索和访问。目前已收录5百种期刊。 PMC与PubMed的关系:两者都是NLM建立的数据库。其中PubMed是一个基于互联网的文献检索系统,它收录了几千种生命科学期刊的目次和文摘,目前数据已回溯至1966年,该数据库提供了与PMC全文的链接以及与数千种期刊网站的链接。而PMC是由NLM建立的免费生命科学电子期刊全文数据库,目前收录期刊百余种,PMC的所有论文在PubMed中都有相应的记录。
清明放假,玩得很hi
清明假日从4.4到4.6.这几天一直在玩,没有做事。现在要将精力逐步转移到工作中来。
清明带着女朋友,和弟弟到姐姐哪儿玩了两天,玩得很hi。
现在,要先将之前数据库丢失的blog文章重新写回来。然后将重心转移到转录组测序分析上。
wordpress备份很重要,一定要注意!
3月20日到现在4月3日之间写的好多东西都丢了。幸亏3月20日还备份了以下数据库文件。不然所有的数据都会丢掉!
看来一定要定期备份wordpress!
悲剧!这个期间写了好多的东西,又要重新补上!
泪奔!
先搞清楚最安全的备份措施先!