由于之前的1年将文章全都写入到其它地方。而现在我的博客完全转移到了阿里云平台，因此更加稳定了。现在将博客内容转移到过来。

呼吸益肾法是中国古老的一种回春术，先将体内污浊空气全部排出，然后再把新鲜空气吸进去，这种呼吸方法称之为“吐故纳新”，也是呼吸益肾法的基础。呼吸法能使人身健康，预防疾病，进而能防止衰老，达到益精回春，旺盛性功能的效果。

1. 腹式呼吸法

两手放在肚脐下，就可以轻易地察觉出空气腹内的情况。姿势可立可坐，慢慢地吸氧，然后在刹那间将它大口吐出。习惯腹式呼吸法之后，再求精神贯一。只要有空，随时可进行2、3分钟。此法使腹部肌肉充分的收缩再放松，可加速血液循环，消除腹腔，肠系膜的瘀血。如此继续两周，身体就会自然感到清爽，食欲大增，肌肤红润。

2. 吸缩呼胀法

此种呼吸法是上述腹式呼吸法的逆呼吸法，中国古代仙人做为长寿不老回春术的秘修之法。

首先坐在椅子上，或取立姿，开始时将肺中污浊空气排出，然后将肌肉放松使全身力量消除，然后再努力吸气，将腹部用力往里收缩至最大程度为止。接着把肩部放松，一面使腹部胀起来，慢慢将空气吐出，反复练习２至３次以后，就能简单地使用此法了。

此外，要注意吸气时将舌尖巾于上齿后面，完全用鼻子来吸气；吐气时舌头要附于下颔由口中吐气。练习此法，要精神贯注，使自己觉得气流到体内的每个角落。

3. 提肛益肾法

这种提肛运动益肾很简单。首先坐在椅子上，使精神集中，轻闭双目，然后慢慢地在肛门上用力，再使用一口气将它缩紧，有如排尿时中途停止的要领一样。接着立刻将力量放松，使肛门松弛，把肛门再次地收缩、放松，如此反复地作3分钟，就会熟练。

在肛门收缩时，阴茎就会提高，象拉弓似的感觉，每日反复练习，括约肌就会变强，久之勃起可随心所欲。

提肛运动不仅能张精，且有长寿不老、永葆青春的效果。

4. 回春式呼吸法

把“腹式呼吸法”、“吸缩呼胀法”与“提肛运动”结合起来的益精法，称为回春式呼吸法，反复练习，可有很大的益肾强精效果。

此法是吸气时使腹部凹下去，同时配合一定的时间，把肛门的括约肌也紧紧地收缩；反之在吐气时，使肛门括约肌松弛。练习此法还要注意，吸气时要慢慢地、深深地使气吸到肛门的部位，深深的吸气，然后再慢慢地放松

博士3年级完毕了，仍要继续到4年级。

我在硕士研究生阶段主要从事了茯苓连作障碍的研究，但最终没有实际的成果。我反省了下，认为是以下3个原因造成的：1. 性格因素。当时还比较年少，责任心不够，同时对硕士研究生的内涵理解肤浅。这些造成了对做实验的态度不积极，在科学研究的时间上投入太少；2. 课题特性。茯苓的连作障碍，这个课题偏向基础性研究，同时，有关于连作障碍的机理还未有在其它物种中有报道，一般只是一些猜测和讨论。相较于我们实验室的科研水平，这个课题算是比较难的；3. 耗材与仪器。主要实验所需要的耗材一般要等2~3个月，而仪器是使用外校实验室的仪器。这样在时间和仪器使用和人员沟通上比较费事。后来，虽然在这个课题上做出了一点成果，但是也未能很好地总结出一点成果，用于发表文章。最后，转博后，将工作重心放到了生物信息学的研究上。

从博士1年级开始，逐步摸索生物信息学，到现在算是两年半了。到现在，对生物信息学的掌握程度自认为可以算是专家了。生物信息学是现在的潮流和前沿，特别是基于第二代测序技术发展而来的一系列新的事物。因此，生物信息学成了一个很新很难的学科，同时，各个实验室对生物信息学的需求与日俱增。

在掌握这些最新的生物信息学技能与知识的道路上，我经历了许多的孤独与坎坷，通过不断看文献，找新方法和新软件，阅读文档，找它人心得等方法，不断去掌握生物信息学的技能。到现在，对生物信息学的很多方法和软件有了宏观和详细的认知，对生物信息学的技能掌握得越来越快。同时，也和很多专业人士的交流也越来越多。

在过去的一年中，是我学习和掌握生物信息学知识最多的一年了，收获良多。学习并熟练掌握的知识主要有：基因组De novo组装、基因预测、RNA-Seq分析、基因组浏览器Gbrowse的使用、基因功能注释、同源基因分析等。上面每一项的生物信息分析都包含很多内容，比较复杂。由于对NGS的数据分析能力，我算是走在了很多人的前头。于是，在刚过去的暑期中，我成功举办了一个NGS数据分析的交流会，将我的经验分享给了很多华农和外地的同学或老师们。

在过去的一年中，我的思想成熟得很快，学习很认真，工作也比较努力。这一年，我的学识上有了飞速的增长。特别是在刚过去的暑期，我参加了上海复旦大学举办的为期10天的进化分析专题培训班和哈尔滨医科大学举办的为期5天的偏向医学的生物信息学培训班。现在，我对生物信息学的宏观把握上算是胸有成竹，对我所在领域的生物信息学技能熟练掌握，对明确知道我今后的生物信息学发展道路。

在过去的一年中，虽然积累了知识和技能，但是未有成果和文章。接下来的一年中，我会将重心放到文章的点子上，争取能早日毕业！

1 培训的准备

在今年4月份的时候就萌生了一个想法，想将自己学到的一些生物信息学知识分享给它人，同时也赚点生活费。后来偶然在一个生物信息的群里面，有人说很想在暑期去上生物信息学班，学习到实用的知识；同时又抱怨华大等举办的生物信息学培训班不仅学费贵，同时也学不到自己动手的东西。于是我就写到考虑在暑期办一个培训班。于是当时一冲动，就在华中农业大学的南湖论坛上发了一个帖子，说想要开一个生物信息学的班。后来很多人回复并感兴趣，于是这成了我举办生物信息学培训班的最大动力。后来在一些回复的要求下建立了一个qq群，于是将培训班的事业拉倒正轨上。

开班培训班，则必须要有培训资料，于是就开始整理培训资料。其实这些培训资料很多都是取自我零零散散写到我的blog上的内容。在今年暑假7.14-7.24日，我参加了复旦大学举办的一个进化分析的培训班。那个时候白天上课，晚上就在宾馆写培训资料，同时准备上课的数据。培训资料和数据的准备绝大部分是在那个时候完成的，当然，由于比较匆忙，在最后一章的内容就写得粗糙了，同时培训资料中还有很多的错别字等。

通过qq群的通知，培训时间确定在7.27日下午3点进行一个试讲，讲述培训的大纲；而从7.28日开始正式的讲课。

2 培训内容

这次的生物信息培训主要是NGS数据的分析，是现在比较成熟又热门的知识。讲解了基因组的组装、基因预测、SNP分析、转录组分析、基因功能注释等，还包含了网站搭建，mysql使用和perl编程等。全程课程主要偏重实践运用于上机操作，而原理方面则不会深究。

本次培训的大纲如下：

1.CentOS 6.4 x86_64的安装
2.Linux系统入门
3.Next Generation Sequencing Techonology
4.基因组组装
5.Genom Repeat Sequence Prediction
6.短序列比对
7.Perl入门
8.Variants calling
9.转录组分析
10.基因预测
11.基因组浏览器Gbrowse
12.基因功能注释与富集分析

培训讲义资料有151面，内容还是很丰富的。

3 培训情况

在7.27日下午3点开始培训前试讲，当时天气很热，空调刚开，但是大出我的预料，来了很多人，将会议室都挤满了。现场报名，报名费相对便宜，500元。由于场地不够大，于是随机抽取了部分有意向的人报名，最后总共报名人数27人。当然，有一个高级博后从上海专程到这儿来听课的，像这样的需要优先考虑。报名时，当时收钱的感觉还是很爽的，嘿嘿…这算是我人生的第一桶金，但是紧接而来则是要多学员负责，要教给他们有用的知识了。

培训，准确说是集训，从7.28日开始，每天早上9:00-12:00，下午2:00-5:00，晚上7:00-9:00上课。这样总共持续了10天，其中包含放假了一天。刚开始两天，早中晚都讲课，后来晚上就专门用来练习，手把手答疑了。最后一天，人人都很累，同时培训资料最后一章也写得比较简略，数据也准备的不是很充分，于是结束课程也算比较匆忙。想起来，当初我做刚生物信息学，就是从最后一章基因功能注释的内容开始的，对这一章的内容，其实了解得非常深入。

最后，所有的学员在实验室门前合了一张影，作为留恋：

4 我的培训收获

通过这次培训，我认识了一些人，很多人给我留下了深刻的印象。比如：从上海特异过来的高级博后，本身对NGS分析很感兴趣，学得很快；基因楼的爱学习，喜欢辩论的小伙子；在测序公司工作几年后回来继续读书的，问题很多的同学；还有刚发表了Nature techonology马上去瑞士读博士的牛人；在空调口吹风又很活跃的一群人；也有喜欢钻研的女生等。

培训课上也有一些同学退学，也有一些同学加入，也有人苦苦支撑到最后。

作为老师，我也学到了很多上课经验。在培训课上，上课是讲一会儿，上机一会儿，造成了课间休息不规律；上课节奏要慢，吐词要清晰等。当然，对培训课程进度的把握，现在有了经验。原本准备在3~5天内讲完，但是在很快的节奏下也需要了9天的时间。

5 总结

本次培训，通过手把手教导怎么进行NGS分析与上级操作，学员们最后能独自自主进行高质量的：基因组组装，SNP和INDEL检测，基因预测及其可视化，转录组分析，基因功能注释等。

培训资料最后只是发放了纸质版的，电子版的由于版权等问题暂时保留在我手上。以后要是有时间，我考虑要出一本NGS分析的生物信息学书籍。

培训班在8.6日结束，随后8.13-8.25参加了在哈尔滨医科大学举办的生物信息学培训。于是原本预算的第二届生物信息学培训班就没有举办了。这个时候群里面的王志文在群里面打了下广告，貌似在洪山体育馆那儿举办了一期生物信息学培训班。

慢慢筹备我的下一次的培训吧，估计内容会更加丰富…

1. 灵魂与轮回

今天一QQ好友说信主已有1年多，出于好奇，我于是对其信仰和他讨论了一下。

为什么信主，他说：“耶稣是永生神的儿子，他为了世人的罪被订在十字架上死了；人是有灵魂的，信了耶稣，死后灵魂就可以去天堂和神在一起。”

他说其小时候的经历让他相信了灵魂的存在：“以前小时候我大伯带我去游泳，我想从游泳池边上跳到水中游泳圈里，结果跳歪了，没进游泳圈旁边去了。然后我就看见我在水里挣扎，看见哦，就是灵魂出窍了。”

我想估计是他小时候的事情让他相信了灵魂的存在，现在他在国外接触了一些教义，顺其自然地信主。他推荐我读这本书：Many Lives Many Masters。他说通过这本书能知道灵魂确实是存在的。

《Many Lives Many Masters》这本书的中文名是《前世今生，生命轮回的前世疗法》，作者Brian L. Weiss。可以在百度百科中查看本书的介绍。

本书中描述了人在死后，灵魂进入一道温暖的白光中，可能会与灵性大师交流，然后进行下一轮命运。作者作为心理医生，对一名女性患者使用催眠术进行治疗，揭露了其很多轮前世的记忆片段；而作者重点关注了其死亡时的片段。

2. 通灵

在《Many Lives Many Masters》书最后，作者说其女性患者又通过一名通灵占星师对其前世的预测，和催眠得到的结果一致。

于是我有又想找一些通灵相关的东西，于是找到了介绍嘎玛仁波切传奇事件的博客：湖心亭看雪客新浪博客和有关轮回的《西藏生死书》

PubMed Central (PMC 公共医学中心)是一个提供有关生命科学与生物医学的回溯性电子期刊全文数据库，它是在2000年1月由隶属美国国立图书馆(NLM)的国家生物技术信息中心(NCBI)所创建与管理的。PMC采取自愿加入的原则，某期刊一旦加入，必须承诺期刊出版后一定时期内（最好六个月，不超过1年）将其全文提交给PMC，由PMC提供免费全文检索和访问。目前已收录5百种期刊。 PMC与PubMed的关系：两者都是NLM建立的数据库。其中PubMed是一个基于互联网的文献检索系统，它收录了几千种生命科学期刊的目次和文摘，目前数据已回溯至1966年，该数据库提供了与PMC全文的链接以及与数千种期刊网站的链接。而PMC是由NLM建立的免费生命科学电子期刊全文数据库，目前收录期刊百余种，PMC的所有论文在PubMed中都有相应的记录。

清明假日从4.4到4.6.这几天一直在玩，没有做事。现在要将精力逐步转移到工作中来。

清明带着女朋友，和弟弟到姐姐哪儿玩了两天，玩得很hi。

现在，要先将之前数据库丢失的blog文章重新写回来。然后将重心转移到转录组测序分析上。