FoxitReader在CentOS6中的使用

在FoxitReader官网上下载了适合于Linux的软件,但是使用的时候提示如下错误:

FoxitReader: error while loading shared libraries: libgtk-x11-2.0.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory

解决方法:

# yum provides \*/libgtk-x11-2.0.so.0
# yum install gtk2-2.18.9-12.el6.i686

第一条命令查看提供文件libgtk-x11-2.0.so.0的rpm包,第二条命令安装对应的包。
现在可以正常运行FoxitReader命令,但是在终端中会有一些Gtk-Message,安装如下包可以解决:

# yum install PackageKit-gtk-module-0.5.8-21.el6.i686 \
libcanberra-gtk2-0.22-1.el6.centos.i686

454测序与组装

软件安装

$ tar zxf DataAnalysis_2.9_All_20130530_1559.tgz
$ cd DataAnalysis_2.9_All/
$ sudo yum install zlib-devel.i686 \
libXi-devel.i686 libXtst-devel.i686 \
libXaw-devel.i686          在CentOS6 x86_64系统中需要安装这些。
$ ./setup.sh        这一步产生图形化界面,安装很简单。

2012-2013学年度 学年鉴定

博士3年级完毕了,仍要继续到4年级。

我在硕士研究生阶段主要从事了茯苓连作障碍的研究,但最终没有实际的成果。我反省了下,认为是以下3个原因造成的:1. 性格因素。当时还比较年少,责任心不够,同时对硕士研究生的内涵理解肤浅。这些造成了对做实验的态度不积极,在科学研究的时间上投入太少;2. 课题特性。茯苓的连作障碍,这个课题偏向基础性研究,同时,有关于连作障碍的机理还未有在其它物种中有报道,一般只是一些猜测和讨论。相较于我们实验室的科研水平,这个课题算是比较难的;3. 耗材与仪器。主要实验所需要的耗材一般要等2~3个月,而仪器是使用外校实验室的仪器。这样在时间和仪器使用和人员沟通上比较费事。后来,虽然在这个课题上做出了一点成果,但是也未能很好地总结出一点成果,用于发表文章。最后,转博后,将工作重心放到了生物信息学的研究上。

从博士1年级开始,逐步摸索生物信息学,到现在算是两年半了。到现在,对生物信息学的掌握程度自认为可以算是专家了。生物信息学是现在的潮流和前沿,特别是基于第二代测序技术发展而来的一系列新的事物。因此,生物信息学成了一个很新很难的学科,同时,各个实验室对生物信息学的需求与日俱增。

在掌握这些最新的生物信息学技能与知识的道路上,我经历了许多的孤独与坎坷,通过不断看文献,找新方法和新软件,阅读文档,找它人心得等方法,不断去掌握生物信息学的技能。到现在,对生物信息学的很多方法和软件有了宏观和详细的认知,对生物信息学的技能掌握得越来越快。同时,也和很多专业人士的交流也越来越多。

在过去的一年中,是我学习和掌握生物信息学知识最多的一年了,收获良多。学习并熟练掌握的知识主要有:基因组De novo组装、基因预测、RNA-Seq分析、基因组浏览器Gbrowse的使用、基因功能注释、同源基因分析等。上面每一项的生物信息分析都包含很多内容,比较复杂。由于对NGS的数据分析能力,我算是走在了很多人的前头。于是,在刚过去的暑期中,我成功举办了一个NGS数据分析的交流会,将我的经验分享给了很多华农和外地的同学或老师们。

在过去的一年中,我的思想成熟得很快,学习很认真,工作也比较努力。这一年,我的学识上有了飞速的增长。特别是在刚过去的暑期,我参加了上海复旦大学举办的为期10天的进化分析专题培训班和哈尔滨医科大学举办的为期5天的偏向医学的生物信息学培训班。现在,我对生物信息学的宏观把握上算是胸有成竹,对我所在领域的生物信息学技能熟练掌握,对明确知道我今后的生物信息学发展道路。

在过去的一年中,虽然积累了知识和技能,但是未有成果和文章。接下来的一年中,我会将重心放到文章的点子上,争取能早日毕业!